Durant l'ère féodale au Japon, deux grands clans de ninja s'affrontent : les Byakuro et les Kabusu. Une nuit, le clan Kabusu organise une attaque sur le château Byakuro dans le but de capturer leur jeune princesse mais cette tentative échoue. En effet, à cette époque, la princesse encore enfant est sauvée par un mystérieux ninja.

Quelques années plus tard, le conflit continue de faire rage et le clan Kabusu envoie à l'assaut du château une équipe de six ninjas. "Stagiaires", ils devront s'y infiltrer et y dérober un parchemin sacré qui leur permettra d'achever leur entraînement. Mais leur chemin risque d'être pavé d'obstacles…