A travers ces trois volumes, nous suivons l'histoire de Hamtaro, petit hamster vivant de nombreuses aventures avec ses amis et sa maîtresse. Découvrant le monde ainsi que la vie, le jeune Hamtaro devra user de toutes les ressources possibles et imaginables face aux dangers que peut rencontrer un hamster (comme un chat errant ou une forte pluie).

La série raconte l'histoire d'Hamtaro, un hamster, appartenant à une jeune fille de 10 ans nommée Laura Haruna (la jeune maîtresse d'Hamtaro) (Hiroko Haruna dans la version japonaise). Curieux de nature, il s'aventure tous les jours à la recherche de nouveaux amis et de nouvelles aventures avec son groupe d'amis nommé les Ham-Ham, composés notamment de Hamiral (le chef), Hamidou (le voisin d'Hamtaro), un hamster, appartenant à une meilleure amie de Laura Haruna nommée Anna Iwata (la jeune maîtresse d'Hamidou) (Kana Iwata dans la version anglaise et japonaise), Bijou (l'amoureuse d'Hamtaro) (elle est russe dans la version française — voir l'épisode 4 — et française dans les versions japonaises et américaines) appartenant à une jeune fille nommée Marina (la jeune maîtresse de Bijou) (Maria-Chan dans la version japonaise) Chapo, Topla, Pashmina, Pénélope, Les jumeaux Tigris et Tigrette (le frère et la sœur), Ronpschit, Librius, Babos, Panda, Ernest, Manitou, Paprika, etc.