Nous retrouvons dans cette deuxième saison tous les protagonistes qui ont fait le succès de la première. Ils sont toujours aussi déjantés voir plus qu'avant. Dans cette saison, nous suivrons leur entraînements. Ils devront évoluer assez rapidement car le tournoi inter-lycées arrive à grand pas. Les membres du club devront se mesurer à un adversaire particulièrement fort et mystérieux qui n'est autre que M. Tondemon. Qui sera le vainqueur de cette ultime affrontement ? Tel sera l'enjeu du Battle Club.