L’histoire commence avec Hayama Akito, bad boy, et Sana Kurata, 11 ans, en primaire et actrice, qui ne supporte plus de voir Akito faire baisser ainsi le niveau scolaire. Quand elle découvre qu’il fait en réalité du chantage aux professeurs, elle décide de se venger. Avec l’aide de Tsuyoshi, un ami d’Akito qui ne supporte plus ses mauvaises actions, elle réussit à prendre une photo de lui le pantalon baissé, et commence à lui faire du chantage. Elle décide de suivre Akito jusqu’à chez lui et découvre alors plus de choses qu’elle n’en voulait. Elle voit Akito se faire jeter dehors par sa sœur, qui le traite au même moment de monstre et d’assassin. On découvre, plus tard, que sa mère est morte en accouchant, et c’est la raison pour laquelle les membres de sa famille le haïssent autant.

Shuri Otokawa, parce qu'elle possède le don de lire dans les pensées des gens, vit en se distançant de tout et déteste particulièrement les hommes. Seule sa tante n'est pas effrayée par son don et l'engage dans son agence de détective privé, l'office S. Là bas, Shuri aide à résoudre différentes affaires et vient même en aide au FBI. Mais lorsque Shuri décide enfin d'aller de l'avant son ex petit ami Riki Nijihara, qui est la source de sa haine contre les hommes, est engagé par sa tante à l'agence. Shuri sera contrainte de travailler avec lui.

Water regroupe quelques unes des premières histoires courtes de Kiriko NANANAN. On y croise une jeunesse japonaise qui peine à trouver sa place dans la société contemporaine, et en quête perpétuelle de l'âme sœur. Autant de pages d'amours surprenantes, intimes, délicates et sombres, servies par un dessin singulier, fin et contrasté.