Chizuru est partie d'Edo pour rallier Kyoto, à la recherche de son père qui est venu dans cette ville il y a six mois et dont elle n'a plus de nouvelles. Presque arrivée à destination, elle est poursuivie par deux samouraïs. C'est alors qu'ils sont attaqués par deux hommes qui semblent possédés. Alors que l'un deux est sur le point de s'en prendre à elle, elle est sauvée par trois jeunes hommes qui s'avèrent faire partie du Shinsengumi. En discutant avec eux le lendemain, elle apprend qu'ils sont aussi à la recherche de son père. C'est ainsi qu'elle va rester sous la protection du Shinsengumi et spécialement du vice-capitaine Hijitaka, le temps que son père soit retrouvé.

Chizuru Yukimura est toujours à la recherche de son père, sous la protection affermie des membres du Shinsengumi alors que le remède crée par son parent fait des ravages au sein de cette police spéciale. Le temps des Samouraïs semblant révolu, Chizuru se retrouve confrontée à son passé. En effet, ses souvenirs d'enfance commencent à refluer. La confrontation avec son frère jumeau dont elle renie encore, inconsciemment, l'existence semble inévitable.

Comment est-ce que Yukimura Chizuru, fille du docteur Yukimura Kôdô, en est-elle arrivée là ? Dire qu’elle voulait seulement retrouver son père, parti à Kyoto en tant que médecin volontaire... Et la voilà prisonnière d’Hijikata Toshizo, le vice-chef du Shinsengumi, persuadé que Chizuru est un samurai. Évidemment, se déguiser en garçon n’était peut-être pas une si bonne idée que ça... Un peu avant, la jeune fille s’est retrouvée au milieu d’un combat entre le Shinsengumi et des démons. Heureusement, après qu’elle ait donné son identité, Hijikata s’aperçoit qu’ils recherchent la même personne. Peut-être que ces deux-là vont s’entendre, finalement...