L’histoire tourne autour d’un lycéen nommé Sorata Kanda qui vit dans la résidence excentrique, Sakurasou. Un jour, la belle Mashiro Shiina, une artiste renommée, emménage dans cet immeuble. Cependant, Mashiro a un véritable problème : Elle n’est pas autonome, elle n’a pas le sens de l’orientation et sa chambre est un véritable bordel. Les camarades de Sorata le désignent comme tuteur de Mashiro afin de s’occuper d’elle. Et c’est ainsi que débute la relation peu ordinaire entre un « Maître et son Animal de Compagnie. »