Shin-chan est en croisière avec ses parents, sa soeur, son chien et, bien sûr, toute sa troupe de joyeux lurons ! Une croisière qui semble être paisible... Mais un matin, tous les adultes disparaissent du bateau ! Le petit Shin-chan n'a d'autre choix que de partir à leur recherche, au fin fond de la jungle.

Shin Chan, surnom de Shinnosuke Nohara, est un petit garçon de 5 ans. Turbulent et mal élevé, il n'arrête pas de faire des bêtises malgré les remontrances de sa mère Mitsy (pour la version française) qui s'occupe seule de lui pendant la journée. Son père Harry rentrant assez tard du travail. La série nous raconte donc les mini-aventures de Shin Chan, entouré de ses amis et de son chien.