Danchi Tomoo raconte l'histoire d'un élève de CM1 nommé Tomoo Kinoshita, qui vit dans le Complexe Résidentiel d'Edajima avec sa mère Tetsuko et sa sœur Kimiko, tandis que Tetsuo, son père, vit en appartement urbain. Bien qu'étant rempli de gags plutôt surréalistes, "Danchi Tomoo" montre aussi les émotions et péripéties de la famille Kinoshita ainsi que celles de leur amis et voisins.