En un instant, le quotidien de toute l'humanité vole en éclats et l'enfer déferle sur Terre. Des nuées d'insectes volants aux piqûres mortelles déferlent brusquement partout à travers le monde, rapidement suivies de monstrueuses "poupées" géantes qui déciment la population. Face à cette menace, Iruma Ikaruga, un lycéen au moral d'acier, va tout faire pour tenter de sauver son meilleur ami et la fille dont il est amoureux, mais l'énigmatique envahisseur est implacable !