Dans le lycée pour filles d'Uranohoshi, Chika Takami admire depuis leur début le groupe ?'s, porté par Honoka Kôsaka. Bien décidée à vivre elle aussi son rêve, la jeune fille va tenter de former un nouveau groupe d'idols avec Hanamaru Kunikida, Dia et Ruby Kurosawa, Kanan Matsuura, Mari Ohara, Riko Sakurauchi, Yoshiko Tsushima et You Watanabe. Nous suivons leur quotidien, qui a pour but de faire connaitre leur groupe Aqours.

Le film Love Live! School Idol Project est annoncé à l'occasion du cinquième anniversaire du groupe d'idoles du même nom.Il s'agit de la suite directe de la deuxième saison de l'anime. Alors que la cérémonie de graduation des troisième années se terminent, le groupe µ's s'était fait à l'idée que son parcours s'arrêterait là. Effectivement, trois de leur membres qui étaient en troisième année viennent d'être gradués du lycée et n'ont donc plus le statut de School Idol : il leur est donc impossible de continuer leur activité au sein du groupe. Néanmoins, Koizumi Hanayo reçoit soudainement un message très surprenant qui marque alors le début d'un nouveau départ pour le groupe !

L’histoire se déroule à l’Academie Otonokizaka qui est sur le point de fermer ses portes par manque d’inscriptions. Quand une lycéenne du nom d’Honoka K?saka l’apprend, elle est grandement bouleversée et décide de tout faire pour empêcher la fermeture de son école. Elle découvre les idoles scolaires du lycée UTX et réalise alors que devenir une idole pourrait être la meilleure solution pour augmenter la popularité de son lycée et ainsi attirer plus de personnes.

La charmante petite ville portuaire de Numazu est entourée à la fois par la mer et par les montagnes. Depuis son plus jeune âge, Yohane a bien du mal à s’intégrer à cet environnement et préfère vivre à l’écart des autres habitants. Au quotidien, elle se questionne sur le but de sa vie, et sur sa véritable place dans ce monde… Ce monde est si mystérieux… Et si la solution était de partir l’explorer ?

Kanon Shibuya avait un rêve. Passionnée de chant depuis sa plus tendre enfance, elle n’a toujours eu qu’une envie : entrer dans la prestigieuse section musique du lycée pour filles de Yuigaoka. C’était sans compter sur sa voix, qui s’arrêta soudain lors de son examen d’entrée au lycée, l’empêchant de démontrer tout son talent à ses futurs professeurs… Admise dans une autre section, elle décide alors d’abandonner son rêve. Jusqu’à ce jour fatidique de rentrée où, se croyant seule, elle entonne une chanson, tapant dans l’œil de Keke, sa nouvelle camarade de classe passionnée par les idols…

Le lycée de Nijigasaki est connu pour la diversité de ses clubs et la liberté qu'il donne aux élèves. Yuu Takasaki, élève de première, a été séduite par la prestation de l'idole Setsuna Yuuki, élève de terminale. Elle frappe donc à la porte du club d'idoles scolaires avec son amie, Ayumu Uehara. Parfois amies, parfois rivales, les membres de ce club apportent au groupe leurs propres réflexions et motivations.