L'animé tire son origine d'une pièce de théâtre écrite par l'écrivain belge Maurice Maeterlinck en 1908.

Un soir de noël, la mère de deux enfants tombe malade.

Ses deux enfants du nom de Tyltyl et Mytyl, vont dans leur tristesse faire la connaissance d'une gentille fée qui leur rend visite ce jour la. Leurs donnant comme cadeau, un pendentif leurs permettant de voyager vers un monde magique et féerique.

Dans ce nouveau monde, les deux enfants doivent retrouver l'Oiseau Bleu qui a le pouvoir de guérir leur mère. Ils seront accompagnés dans leur quête d'un chien, d'une chatte et de six esprits.

Ils feront la rencontre de la Reine de la Lumière qui leur confiera une mission, celle de trouver et tuer la Reine de la Nuit en leur confiant comme seule arme, une dague...