Nous sommes à la fin de l'ère Meiji, au moment où le Japon s'occidentalise et commence à se moderniser. Un brillant poète, Takuboku Ishikawa, démarre une activité de détective en réaction à une affaire de meurtre. Il l'appelle le bureau du détective Woodpecker.

Il est alors entraîné dans une étrange affaire autour de phénomènes surnaturels par le biais d'une connaissance de sa ville natale, Kyôsuke Kindaichi, qui devient son assistant. D'autres auteurs de son époque comme Kodo Nomura, Isamu Yoshii, Sakutarô Hagiwara et Bokusui Wakayama participent également aux exploits de cette curieuse agence…