Gunpla Battle Nexus Online est un nouveau jeu en réseau qui permet aux participants de jouer à plusieurs missions en utilisant des Gunpla dans un cyberespace virtuel. Riku Mikami et Yukio Hidaka sont des collégiens qui vont recruter leur camarade de classe Momoka Yashiro et plonger ensemble dans ce vaste univers. Devenant des "Divers", le nom donné aux habitants de GBN, ils rencontrent une mystérieuse jeune fille nommée Sarah qui a une affinité particulière avec les Gunpla. Ils commencent alors à jouer à ses côtés mais... Il y a beaucoup de Divers célèbres tels que Kyoya Kujo, le champion que Riku admire. Plusieurs Divers peuvent former une équipe nommée "force". Cependant, le jeu est parasité par des Mass-Divers qui utilisent des outils non-officiels appelés break decals. Au travers de multiples rencontres et expériences, Riku et ses amis devront non seulement construire leur Gunpla mais aussi leur propre aventure. (Synopsis issu et traduit du site gundam.info)

Il s'agit d'un projet commémorant les 10 ans de la saga "Gundam Build". Un nouveau service Internet a été créé dans le monde de Gunpla. Dans le Metaverse, les utilisateurs peuvent déplacer leurs avatars, qui sont leurs alter ego, interagir avec d’autres utilisateurs, mener des batailles de Gunpla et même acheter des Gunpla. Rio Hojo, un garçon qui a sauté dans ce nouveau monde, a appris les techniques de construction de Gunpla auprès de Seria Urutsuki dans le monde réel, et s’est vu enseigner le savoir-faire en matière de combat de Gunpla par Mask Lady dans le Metaverse, où il a perfectionné ses compétences jour après jour. Après avoir terminé son propre Gunpla, « Lah Gundam », Rio rencontre par hasard dans le Metaverse les anciens héros de Gunpla…