Note : ces OAVs font directement suite à la série TV, il est donc déconseillé de les visionner avant la série tv. Les canons des Leo, Virgo, Taurus et autres Gundams se sont tus voilà quelques années. Le combat pour l'indépendance des colonies spatiales qui a tant fait couler le sang n'est plus. Cependant un air de révolte flotte dans l'espace. Une fillette prénommée Marimeia Khushrenada, fille de l'ancien leader Treize Khushrenada, décide de relancer les hostilités entre les colonies spatiales et la Terre. Les pilotes de Gundam à l'exception de Chang Wu-Fei sont contraints de reprendre les armes, alors que jadis ils étaient le fer de lance de la révolte des colonies. A la tête de son armée privée et aidée du pilote de Gundam Chang Wu-Fei, Marimeia commence d'abord par prendre en otage Helena Darlian, haut fonctionnaire de la Terre et amie du pilote de Gundam Heero Yui.

Heero s'est infiltré sur la base lunaire pour supprimer le Docteur J et cinq autres scientifiques qui tentent de coopérer avec OZ. Mais il est traqué par Trowa, maintenant officier d'OZ qui cherche à assassiner Treize ! C'est le choc entre ces deux pilotes de Gundam qui étaient autrefois des amis.