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Après un terrible accident où il perdit l'hémisphère gauche de son cerveau, le célèbre scientifique Francis Dullam, connu pour ses travaux en mathématiques et en physique, se mit en tête d'étudier les dauphins. Après des milliers d'heures passées auprès de ces animaux, il présenta une vidéo comme thèse de ses travaux, que personne ne prit au sérieux. En parcourant les archives du professeur Dullam, le jeune étudiant Ishii Mitsunari découvrit l'idée derrière cette vidéo, qui lui permettrait de créer l'ultime Intelligence Artificielle et de renverser l'ordre mondial. Il embarque alors pour l'île d'Okinawa afin de poursuivre les travaux de son idole.