C'est l'histoire de 4 filles : Mikaze, Karin, Ayamo et Shizuha qui sont pilotes d'avions stratosphériques (d'où le petit jeu de mot du titre en anglais !) et qui ont pour but l'interception de débris provenant de comètes. En effet, par le passé une comète s'est écrasée sur Terre causant d'importants dégâts. Cet événement a entraîné la création d'équipes terrestres dont les 4 filles font partie et d'équipes spatiales, les Comet Blaster. Nos 4 filles rêvent un jour d'appartenir aux rangs des Comet Blaster. La Terre est sur la trajectoire d'une vaste vague de comètes et nos 4 amies vont avoir du boulot devant elles. Pourquoi les comètes se dirigent-elles vers la Terre ? Est-ce vraiment par pur hasard ? Avec son lot de complots gouvernementaux, cette série ravira les amateurs du genre.

Tachibana Mirei, Oaki Kiriko et Minomiya Mana arrivent Sur la base d'interception de Shimojijima pour remplacer Mikaze, Karin, Ayamo et Shizuha qui sont parties passer l'examen d'entrée dans la force spatiale d'interception. Mais malheureusement, elles rate leur examen et sont donc de retour sur la base. En effet un tout nouveau système d'interception automatique des météorites a été mis en place. Et pour couronné le tous, le QG des forces d'interception à confisqué le Stratos 4 ! Ca devient de plus en plus dure pour les hommes et les femmes sous les ordres du Capitaine Reynold. Arriveront-ils à rendre l'honneur à la base de Shimojijima ?