Un jour, Kasuga Nozomi rencontre un étrange garçon à son école, qui l'envoie à travers le temps et l'espace tout droit à Kyou, dans un autre monde qui ressemble fort à Kyoto vers la fin de la période Heian. Là, le clan Minamoto («Genji»), dirigé par Minamoto no Yoritomo, est en guerre avec le clan Taira ("Heike"), dirigée par Taira no Kiyomori. Le clan Heike a espoir de vaincre le clan Genji en libérant des esprits vengeurs, qui perturberont l'écoulement naturel de la terre... Le chef du clan Gengi demande alors à Nozomi et ses amis de conclure une alliance avec le clan Kumano afin de remporter la guerre...