Au fil du temps, certains humains ont développé des capacités extraordinaires appelées Minimum qu'ils peuvent déployer quand certaines conditions sont respectées. La police ayant parfois du mal à régler plusieurs affaires, elle n'hésite pas à engager l'agence de détective Hamatora. Dirigée par Murasaki et Nice, deux détenteurs de Minimum, l'agence est connue pour accepter et conclure n'importe quel type de contrat tant que celui-ci est rémunéré. Leur route va ainsi croiser celle d'un mystérieux serial killer ne s'en prenant qu'à des utilisateurs de Minimum.

"Certaines personnes sont nées avec un don appelé "minimum" ; un pouvoir qui leur permet de réaliser des petits miracles. Pour permettre à ces utilisateurs de les contrôler, l'Académie Facultas a été crée." L'histoire se déroule à Yokohama où Murasaki, un jeune homme diplômé de l'Académie Facultas, doit ramener l'ancien élève prodige, Nice. Il le retrouve alors tenant une petite agence de détective du nom de Hamatora. Il ne peut s'empêcher de douter de la capacité réel de celui-ci en voyant : un habitat désordonné, Hajime, une assistante gourmande pas du tout intéressée par ce qui l'entoure et enfin Nice qui semble aux premiers abords totalement indifférent et qui est un brin pervers. Mais Murasaki va vite changer d'avis quand il verra à l'oeuvre Nice et son "minimum". Aussi il décidera de suivre Nice quelques temps, avant de tenter de ramener à l'académie.