UC 0088, la bataille de Gryps entre l'AEUG et les Titans a fait des ravages. L'AEUG a subit de lourdes pertes : le pilote du Hyaku Shiki Quattro Bageena, alias Char Aznable est porté disparu, Kamille Bidan, pilote du Zeta Gundam, est devenu inapte à quoique ce soit, les dommages subis par le vaisseau sont lourds. L'Argama décide donc d'abord de placer Kamille en hôpital, et pour cela ils se dirigent vers la colonie la plus proche : Shangri-La de Side 1. Cependant, sur Axis, Haman Karn profite de l'affaiblissement de la Fédération pour lancer son mouvement de résurrection de Zeon : Neo Zeon. Sur Shangri-La, l'arrivée de l'Argama est suivie par une bande de jeunes ferrailleurs, pour la plupart orphelins, qui décident d'aller voler le Zeta Gundam qui se trouve à bord du vaisseau avec l'espoir de le revendre. Cependant, une série d'évènement fera que notre bande de jeune deviendront les héros de la guerre contre Neo Zeon, avec Judau Ashta aux commandes du Zeta Gundam...