En l'an 0068 UC, les germes d'un conflit historique prennent racine au sein des colonies spatiales.
La colonie Side 3 abrite ainsi la République de Munzo, qui cherche à prendre ses distances avec la Fédération Terrestre. Ce mouvement est mené par le charismatique politicien Zeon Zum Deikun, qui propose une théorie selon laquelle les hommes doivent quitter la Terre pour atteindre un niveau d'évolution supérieur ; les Newtypes.
Alors au sommet de sa gloire, Deikun est lâchement assassiné par ses rivaux de la famille Zabi, qui usurpent sa position de leader et blâment la Fédération pour le meurtre. Ils font désormais appelé leur État la "Principauté de Zeon" et s'engagent dans une course à l'armement avec la Fédération.
Deikun laisse derrière lui deux enfants, Casval et Artesia. Menacés de morts, ils sont contraints à l'exil et doivent abandonner leur identité et leur héritage. Mais à mesure que la Guerre approche, Casval prend conscience de ses responsabilités ; lui qui se fera plus tard appeler "Char Aznable".