Il existe en Angleterre une école de chant renommée, dirigée par la jeune Fiasse Christella. Alors que l'école se prépare pour la tournée mondiale annuelle, dont les fonds récoltés iront aux démunis et à différentes associations, la directrice reçoit plusieurs lettres de menaces. Après confirmation que ces lettres n'étaient pas à prendre à la légère, elle décide d'engager Ellis McGaren, connaissance de longue date, pour assurer sa sécurité. Viendront se joindre deux autres personnes, Takamachi Kyoya et Myuki, frère et sœur, eux aussi amis d'enfances, ayant comme particularité de maîtriser une technique de combat ancienne, basée sur la maniement des sabres. Malgré leur incroyable puissance et le fait qu'elle les connaisse depuis longtemps, Ellis refuse de leur faire confiance... Arriveront-ils à assurer la sécurité de Fiasse Christella ?

Nonoha est une brillante écolière qui vit entourée de sa famille et de ses amis. Elle n'a aucune confiance en elle et cherche sa vocation. Un jour, elle rencontre un furet blessé, qui n'est autre qu'un jeune garçon venu d'une autre dimension, Yunno. Il s'est rendu sur Terre afin de retrouver les Jewel Seed qui permettent à ceux qui les gardent de pouvoir exaucer n'importe quel rêve. Mais elles peuvent aussi se révéler très dangereuses. Nanoha va essayer de l'aider dans sa quête et elle recevra de mystérieux pouvoirs magiques.