UC 0079, sur la Colonie Side 7, trois Mobiles Suits de Zeon, des Zaku II, entrent dans la Colonie pour y trouver la nouvelle arme de la Fédération, un certain Projet V. Une alerte est déclenchée visant à évacuer les civils de la Colonie. Parmi eux se trouve Amuro Ray, un jeune homme dont le père travaillait sur ce fameux projet V. Il verra allongée sur un camion la nouvelle arme de la Fédération : un Mobile Suit du nom de Gundam.

Alors qu'elle vient tout juste d'être transférée dans son nouveau lycée, Isuzu Sento décide "d'inviter" un garçon de sa classe, Seiya Kanie, à venir avec elle dans un parc à thème : Amagi Brilliant Park. Mais dès leur arrivée, Seiya ne peut que constater l'état déplorable du lieu, qui est au bord de la faillite. Isuzu va alors lui révéler qu'elle y travaille puis va lui présenter la directrice, Latifa Fleuranza, qui lui demande de les aider à reprendre le parc en main. Dans un premier temps, Seiya refuse mais il finira néanmoins par accepter par défi. Il aura alors trois mois pour accueillir 250 000 visiteurs.

Voué à quitter la Terre pour coloniser l'espace, l'homme a fini par accomplir son rêve, et a construit de gigantesques colonies flottant dans le vide interstellaire. Ces cylindres de plusieurs kilomètres, capables de recréer artificiellement en leur sein les conditions de vie terrestre, devinrent ainsi la deuxième patrie de colons qui y vivaient, y mouraient et y élevaient leurs enfants le mieux possible. L'histoire de cette colonisation dans l'espace bascule le jour où, décidé à devenir indépendant, le duché de Zeon - la colonie la plus éloignée de la Terre - déclare la guerre aux Forces Fédérales Terriennes. En un mois à peine, la moitié des combattants de chaque camp trouve la mort, et laisse dans le désarroi les populations civiles. Les affrontements se font ensuite plus sporadiques, mais aussi violents, Zeon et les Forces Terriennes se surveillant mutuellement pour découvrir quels n