Nous sommes dans la deuxième moitié des années '90, Makoto Kubota est un jeune homme, à priori sans attache particulière, vivant une paisible vie partagée entre histoires de Yakuza, petits boulots pas très clairs, meurtres et mah-jong. Cependant un jour, il trouve et recueille un gros chat paraissant à l'agonie et amnésique de surcroit : Tokito. Alors qu'ils vivent tranquillement ensemble, leur passé commence à refaire surface à l'apparition d'une nouvelle drogue sur le marché nommée W. A.

Dans le lycée Araisô, quelques complots se trament, heureusement Tokito Minoru et Kubota Makoto, faisant partis du Comité de Discipline, sont là pour faire régner le réglement du lycée. L'histoire commence quand une nouvelle élève, Katsuragi Kazumi, cherche sa classe dans ce lycée immense, c'est grace à la voix suppliante d'un voyou qu'elle rencontre Tokito et Kubota. Après un départ très froid, Katsuragi entre dans le Comité de Discipline.