Un jeune inspecteur de police de la section mobile d'investigation mobile, Shindo, et sa soeur doivent faire face à leur passé. Victimes d'une catastrophe inexpliquée ayant emporté leur parents, les deux jeunes adultes voient apparaître des monstres appelés Phantom surgissant des profondeurs et qui s'en prennent aux êtres humains. Ces cas sont secrets et gérés par la section Tokkô (Section spéciale de sécurité publique), composée d'inspecteurs d'âge semblable à nos 2 protagonistes et notamment d'une jeune femme qui hantait les rêves de Shindo. Celui-ci décide de venger ses parents morts dans le mystérieux accident de Machida et entre dans la Tokkô, après une épreuve d'intronisation... particulière.