Lors d'un petit boulot comme les autres, un étrange individu projette soudain Gin dans le futur. Un futur bien sombre : cinq ans plus tard, la planète est ravagée, un mystérieux virus a contaminé la population, et les Yorozuyas se sont séparés à la suite... de sa mort. Quelle peut être la cause d'un tel cataclysme, et comment renverser une telle tragédie? Pour l'apprendre, Gintoki devra lutter contre le temps, la destinée, et un adversaire pire encore.