Touma et Index rencontrent lors d'un concert de rue Arisa, jeune chanteuse amatrice. Afin de célébrer la complétion prochaine de l'ascenseur spatial Endymion, elle se voit proposer de faire ses débuts de professionnelle. Cependant, la jeune fille semble posséder un pouvoir qui intéresse plusieurs factions d'Academy City, et pourrait mener à un affrontement entre les mondes de la Magie et de la Science.