Alors qu'Afro, reclus dans un monastère abandonné, tente de se racheter des crimes qu'il a commis, il est rattrapé par son passé, en la personne de Sio. Cette femme dangereuse et magnifique, aidée d'un Kuma revenu d'entre les morts, vole le bandeau de numéro 1 à Afro. Expliquant qu'elle vient se venger de lui, elle subtilise aussi les restes de son père, afin de le ressusciter et de lui faire subir milles supplices. Une seule solution : retrouver le bandeau de numéro 2 et venir affronter Sio, comme l'exige le code des samurais. Avec son alter ego Ninja Ninja, Afro repart donc sur la voie du démon, en quête des bandeaux maudits. Un seul but : empêcher que son père ne meurt une seconde fois, et ce, quel qu'en soit le prix...

Des meurtres commis avec beaucoup d'atrocités rappellent ceux d'il y a quatre ans. Kokutou décide de tirer cette affaire au clair car il pense que Shiki peut en être responsable, vu son état il y a quatre ans. Très vite, il découvre que cette affaire est liée à un trafic de drogue d'un genre nouveau. Pour protéger Shiki, Kokutou est prêt à tout.

En essayant de fuir les voyous dans l'espace, un garçon appelé Ropuru déforme son vaisseau spatial dans des conditions dangereuses et finit par créer une faille dans l'espace-temps. La brèche ouvre un portail entre le vaisseau spatial de Ropuru et la chambre de Nobita. Doraemon et Nobita rencontrent inévitablement Ropuru et son petit copain Chammy. Rapidement, ils deviennent tous amis. Après avoir réparé leur vaisseau, ils finissent par se rendre sur la nouvelle planète de Ropuru, Koya Koya. Le garçon fait partie d'un groupe colonisateur qui est harcelé par une bande de méchants intéressés par un cristal spécial dont la planète est abondante. Nobita et Doraemon décident alors d'aider les colons dans leur lutte pour vivre paisiblement dans cette nouvelle patrie.

Adaptation du roman d'Alex Shearer. Le film reprends les éléments de la série Web, tout en incluant 20 minutes de scènes supplémentaires. Deux jeunes garçons (Huntley & Smudger) tentent de créer une fabrique illégale de chocolat suite à l'interdiction des sucreries dans leur pays par le parti politique "Good For You".