Mei, Satsuki et leur père emménagent dans une vieille maison à la campagne, ils peuvent ainsi se rapprocher de l’hopital où est hospitalisée leur mère. Les jeunes enfants sont heureuses et font la découverte d’étranges petites créatures. En suivant l’une d’elle, Mei tombe sur un Totoro….
En 1945, Seita et sa petite soeur Setsuko deviennent orphelins et sont recueillis par des parents proches mais sont maltraités. Ils décident de quitter cette famille et de tenter leur chance ailleurs. Dans un pays détruit par la guerre, ces deux enfants vont tenter de survivre et de trouver leur bonheur, au milieu des ruines et l'indifférence des autres.