Alors que Conan faisait un peu de rangement chez lui, il découvre une lettre adressée à Shinichi Kudo. Celle-ci contient une invitation de la part de Moriya Teiji, un célèbre architecte. Utilisant son nœud papillon, il demande à Ran d'y aller à sa place. Celle-ci accepte à condition que Shinichi aille à un rendez-vous avec elle. Le jour de ce rendez-vous, Conan reçoit un appel adressé à Shinichi ; un homme se présente comme un poseur de bombes ayant placé des explosifs à plusieurs endroits de la ville. Il défie Shinchi de les trouver avant qu'elles ne provoquent des dégâts. Une course-poursuite est alors lancée entre le petit détective et le mystérieux criminel.

Premier film officiel de Happy Science (mouvement religieux apparu en 1986 au Japon). Un projet autour du scénario a été lancé pour revisiter le livre d'Okawa Ryuho "Ai wa Kaze no Gotoku". 2300 ans avant J-C, l'île de Crète est asservie par le règne tyrannique du roi Minos. Un jour, une plume dorée venant des cieux tombe dans la ville de Sitia et un jeune prince du nom de Hermes né alors. Selon la prophétie, il est destiné à devenir un grand héros qui sauvera la Grèce et la fera entrer dans une ère de prospérité. 26 ans plus tard, il part à l'aventure dans le but de sauver la Crète et gagner la main de la sublime Aphrodite.