À bord d'un luxueux yacht, Conan et toute sa petite troupe au grand complet voguent au gré de cette paisible croisière. Bien évidemment, un évènement viendra rapidement briser cette utopique félicité : le meurtre d'un des passagers. Cet incident déclenchera une réaction en chaîne allant crescendo jusqu'à mettre en péril la vie des 600 passagers car un dangereux terroriste menace de tout faire sauter...

Une sorcière projette de voler le Diamond Line, un bijou qui sert à la reine du Jardin de l'Espoir lors d'une cérémonie pour renouveler l'eau de son pays ! Les guerriers du Jardin de l'Espoir viennent demander leur aide à Nagisa et Honoka...

Camille Bidan, un habitant des colonies spatiales, rejoint l'AEUG, une organisation paramilitaire qui s'oppose aux Titans, un corps d'armée de la Fédération terrestre très influent et détesté dans les colonies spatiales à cause de leur arrogance. Dans le vaisseau Argama, il est le pilote du Gundam Mark 2 et combat au côté de Quatro Bajeena, un pilote de mobile suit très doué. Une opération d'envergure se prépare pour décapiter les Titans, Camille doit y participer...

Depuis plusieurs siècles deux peuples s'affrontent sur la planète Alcyone : les Cévéens et les Storrions. Rares sont les survivants. Avec l'aide d'une mystérieuse prêtresse, les Cévéens ont construit l'ARK, une gigantesque ville- vaisseau qui devrait les aider à fuir cette planète condamnée. Or, l'ARK est tombée aux mains des Storrions, bien incapables de la piloter. Les deux peuples vont disparaître. Leur salut pourrait venir d'une jeune cévéenne adoptée par Jallak, le général storrion…