Yugi est un jeune garçon assez renfermé et ne semble pas avoir le courage de faire le premier pas vers les autres. Mais un jour il parvient à résoudre l’énigme du puzzle millénaire qui est en sa possession. Cet ancien item égyptien va totalement bouleverser sa vie et surtout sa personnalité. Petit à petit, sa gentillesse naturelle, sa passion du jeu et surtout cette pulsion interne qui le pousse à protéger ceux qu’il affectionne, vont faire grossir un cercle d’amis très solide autour de lui...

Yugi, un jeune garçon chétif et naïf réussit un jour à remonter le fameux Puzzle du Millénaire. À partir de ce moment-là, le destin de Yugi va devenir celui d'un être hors du commun. Le Puzzle lui a donné d'incroyables pouvoirs et l'a doté d'un double impitoyable : Yami Yugi, "Le Maître des Jeux!". Lorsque Maximillion Pegasus, l'inventeur du jeu Magic and Wizards apprend la défaite de Seto Kaiba face à Yugi, il décide de voler l'âme de Mûto Sugokoru, le grand-père de Yugi. Son but ? Contraindre Yugi à participer à un Tournoi de Duel de Monstres pour pouvoir s'emparer du Puzzle de Yugi !

Il s'agit d'un film peu connu et assez ancien sur la série Yu-gi-oh ! Sorti le 06 mars 1999 au Japon, soit près d'un an avant le lancement de Yu-gi-oh ! Duel Monster. Le design s'inspire de celui de la "saison 0". Le film raconte l'histoire de Shun, un jeune duelliste amateur qui, par hasard, va un jour se retrouver en possession du Dragon Noir aux Yeux Rouges. La carte étant très rare, Seto Kaiba cherche à s'en emparer, mais Yugi se trouve, une fois encore, sur son chemin.