L'histoire se déroule au lycée Kunugigaoka. Koro-sensei est un alien responsable de la destruction d'une partie de la Lune. Il annonce alors au gouvernement de la Terre qu'il désire être le professeur de la classe 3-E, et rajoute que si aucun de ses élèves n'a réussi à le tuer à la fin de l'année, il détruirait la Terre. Les élèves de cette classe auront donc pour objectif d'assassiner leur professeur afin de sauver la Terre et d’empocher une récompense de 10 milliards de yens.

Compilation de la série sortant simultanément avec Koro-sensei Q. Ce film inclut une histoire inédite se déroulant peu avant les retrouvailles des élèves de la classe, sept ans après qu'ils aient obtenu leurs diplômes. Cette partie se focalise sur Karma et Nagisa.

Episode de dix minutes, Ansatsu Kyôshitsu Deai no Jikan a lieu juste après l'incident ayant causé la destruction partielle de la lune. En guise de préquel à la série originale, nous assistons à la découverte du professeur tentacule Koro-sensei et à l'annonce de son souhait de détruire la Terre dans un an, se donnant ce laps de temps pour enseigner à une classe qui aura comme but de le tuer avant qu'il ne puisse mettre sa menace à exécution.

Ces épisodes speciaux adaptent deux chapitres du tome 9 : le 78 et le 79, dans lesquels un élève de la 3-E choisit de rejoindre la 3-A et compare les différentes méthodes d'enseignement entre les deux classes.

Et si Assassination Classroom se déroulait dans un monde de jeu vidéo RPG ? C'est avec ce pitch de départ qu'a été créé ce spin-off. Ainsi, M. Koro est-il devenu le roi démon, possédant une vitesse surnaturelle à la suite d'un bug du système. M. Karasuma est ici le Lord Commandant des Chevaliers de la Cour et Mme Pouffe une « sorcière de la tentation »... Les élèves de la classe E appartiennent à une école de magie à qui l'on confie la mission d'assassiner Koro, car ils maîtrisent des magies ressemblant à des bugs. Comme dans le manga original, au lieu de menacer la vie de ses étudiants, M. Koro s'efforce de tirer le meilleur de ses élèves, il leur apprend à coopérer, à s'améliorer, à avoir une vision positive d'eux-mêmes afin qu'ils réussissent à s'accepter tels qu'ils sont. À travers des confrontations contre des monstres-parodies des jeux RPG, les élèves apprennent petit à petit

Kusuo Saiki est un étudiant de 16 ans qui possède plusieurs dons surnaturels, dont la télépathie et la télékinésie. Des pouvoirs dont n'importe qui rêverait, mais qui cause à notre héros un certain nombres de problèmes… Kusuo tente malgré tout de mener une vie normale.