La Terre est à l'état désertique après l'holocauste nucléaire résultant des guerres. Seuls survivent de rares individus qui sont devenus les proies de gangs n'obéissant qu'à la loi du plus fort. En ces temps de grande déliquescence, des prestigieuses écoles d'arts martiaux ont vu le jour et enseignent à leurs élèves, aux prix de lourds sacrifices, une autre façon de voir le monde ainsi que la faculté de pouvoir le modifier de façon significative. Elles offrent à leurs héritiers de grandes destinées.Yuria, dès son plus jeune âge a acquis le pouvoir d'entrevoir l'avenir. Elle est placée très tôt sous la tutelle de Ryuken, grand Maître actuel de l'école Hokuto. Ryuken enseigne les techniques du Hokuto Shinken à une poignée d'élèves talentueux, ses "fils". Mais c'est le plus jeune, Kenshiro, qui gagne l'attention et le cœur de Yuria. La beauté de Yuria ne cesse pourtant de susciter des convoitises, notamment celle de Shin qui finit par l'enlever non sans avoir torturé, humilié et marqué Kenshiro à vie. Captive de Shin, Yuria apprend néanmoins à contrôler petit à petit le pouvoir qu'elle détient et s'apprête à devenir le dernier Général du Nanto, l'école rivale du Hokuto.

Kenshiro, a été désigné par Ruyken comme étant le seul et unique héritier du Hokuto Shinken. Cette décision aura inévitablement d'immenses répercussions.Toki, le deuxième des "frères", était pourtant pressenti par beaucoup comme étant le plus talentueux, redoutable en efficacité et alliant même l'esthétique à ses mouvements. Cependant, affaibli par la maladie, le choix s'est reporté sur son plus jeune frère.Toki a accepté la décision prise par son maître. Se sachant condamné, il s'est même sacrifié afin que Kenshiro et Yuria puissent vivre. Il a pourtant survécu aux radiations de la guerre nucléaire. Depuis, il a décidé de s'aventurer sur les plaines désertiques, suivi de Sara, essayant d'apporter des soins aux rescapés grâce aux arcanes du Hokuto Shinken. Il sait pourtant que son destin le rattrapera, qu'il devra faire face à Raoh, et apporter son soutien à Kenshiro en le guidant vers un niveau plus ultime.

L’histoire se déroule dans un futur relativement proche sur une terre ravagée par la guerre nucléaire qui a eu pour conséquence l’évaporation de la plupart des océans et la destruction d’une grande partie de la végétation. Dans cet univers post-apocalyptique, les survivants sont soit d’humbles villageois essayant de survivre, soit des bandits vicieux regroupés en gangs qui s’adonnent aux pillages et à la persécution de ces villageois. Cependant, un artiste martial nommé Kenshiro (Ken), un homme reconnaissable aux sept cicatrices qu’il porte sur le torse, est choisi pour devenir le successeur du légendaire art assassin le Hokuto Shinken (????, l’art divin de l’Étoile du nord). Au début de l’aventure, Kenshiro ne cherche pas réellement à aider les villageois, mais au fur et à mesure que son étoile le guide, il se révèle comme étant le sauveur tant attendu par une population au bord du désespoir. Accompagné dans son périple par deux jeunes enfants nommés Bart et Lynn, Ken affrontera un grand nombre de gangs, allant même jusqu'à affronter ses frères adoptifs, eux aussi disciples de l’art du Hokuto Shinken. Ken se mesurera aussi à certains maitres de l’école Nanto Seiken (????, Le poing sacré de l’étoile du Sud).