Kenshiro se prépare pour la dernière bataille contre son grand frère tandis que le dernier général du Nanto commence son attaque contre l'armée de Raoh. Pendant sa préparation, Ken découvrira alors une personne qu'il n'attendait pas.

Marqué profondément par les blessures que lui a infligées Shin, Kenshiro est laissé pour mort dans le désert. C'est seulement dans un état second qu'il parvient à se débarrasser d'une dizaine de loups attirée par sa dépouille. Une famille de villageois découvre par hasard son corps. Et ce sont les enfants, Dan et Amo, qui se rendent compte finalement qu'il est encore en vie. Toute la famille est néanmoins capturée par un groupe armé d'individus ayant à leur tête, Guruma, un marchand d'esclaves excentrique. Guruma les enferme dans son échoppe à Gesso City, une ville vivant du trafic d'êtres humains, dirigée par le despotique "Shogun", Siska.Kenshiro toujours affaibli physiquement et moralement, partage sa cellule avec la famille de Dan et un mystérieux vieillard, Fugen. Mais Guruma a l'intention de tirer rapidement un bon prix de celui qui a abattu une meute de loups à lui-seul. Pendant ce temps, un dénommé Jugai, pratiquant du Nanto Koshuu Ken, s'apprête à renverser Siska et prendre possession de Gesso City. C'est petit à petit que Kenshiro encore dubitatif d'avoir été désigné l'héritier du Hokuto Shinken, prend conscience de l'attente du peuple et est amené à ouvrir les yeux sur sa destinée.

L’histoire se déroule dans un futur relativement proche sur une terre ravagée par la guerre nucléaire qui a eu pour conséquence l’évaporation de la plupart des océans et la destruction d’une grande partie de la végétation. Dans cet univers post-apocalyptique, les survivants sont soit d’humbles villageois essayant de survivre, soit des bandits vicieux regroupés en gangs qui s’adonnent aux pillages et à la persécution de ces villageois. Cependant, un artiste martial nommé Kenshiro (Ken), un homme reconnaissable aux sept cicatrices qu’il porte sur le torse, est choisi pour devenir le successeur du légendaire art assassin le Hokuto Shinken (????, l’art divin de l’Étoile du nord). Au début de l’aventure, Kenshiro ne cherche pas réellement à aider les villageois, mais au fur et à mesure que son étoile le guide, il se révèle comme étant le sauveur tant attendu par une population au bord du désespoir. Accompagné dans son périple par deux jeunes enfants nommés Bart et Lynn, Ken affrontera un grand nombre de gangs, allant même jusqu'à affronter ses frères adoptifs, eux aussi disciples de l’art du Hokuto Shinken. Ken se mesurera aussi à certains maitres de l’école Nanto Seiken (????, Le poing sacré de l’étoile du Sud).