Cette histoire suit 9 protagonistes particulièrement idiosyncrasiques faisant partie d'une organisation nommée Choujou Kagaku Kirikiri Basara. La moindre chose, même insignifiante pouvant leur arriver aura de grosses conséquences sur eux et sur le monde. Comment vivent-ils malgré cette particularité ?

Occultic;Nine raconte l'histoire de 9 personnes aux caractères très différents. Ils font partie de l'organisation Choujou Kagaku Kirikiri Basara. La moindre petite action les concernant a d'énormes séquelles sur eux et le monde, leur but est de garder un monde normal, tout en suivant une vie normale.