Dans cet animé, nous suivrons les péripéties de l’équipe de foot du collège Raimon, considérée comme une faible équipe ne disposant même pas de onze joueurs pour pouvoir jouer des matchs. Emmenés par leur capitaine Endô, le gardien de but, ils se voient offrir l’opportunité d’affronter l’école de Teikoku, la meilleure équipe du pays, vainqueur du renommé tournoi Football Frontier quarante années de suite. Comment s’en sortiront nos héros face à cette puissante équipe ? Et qui est ce mystérieux Gôenji à la frappe surpuissante nouvellement arrivé au collège Raimon… La suite des aventures de nos héros nous en apprendra davantage.

Inazuma Eleven suit les aventures de la petite équipe de football du collège Raimon. On y suit l'évolution de Mark Evans, un jeune gardien de but, ainsi que de ses amis Axel Blaze, l'attaquant vedette de l'équipe, et Jude Sharp, meneur de jeu hors pair. Ensemble, avec leur équipe, ils se lancent à la conquête du Footbal Frontier, tournois national qui décide de la meilleure équipe de football junior du Japon !