Suzumiya Haruhi est une fille plutôt étrange, elle n'a qu'un seul but dans la vie : rencontrer des personnes du type paranormal, que ce soit aliens, des voyageurs du temps, des exilés de l'espace, etc... L'étrange l'attire et elle n'aime pas trop se mêler aux gens normaux. Kyon, lui, est un jeune lycéen devenu terre à terre après avoir réalisé que tout ces phénomènes paranormaux n'existent pas. Ce dernier va se retrouver finalement dans la même classe que Suzumiya et il deviendra très vite, malgré lui, son acolyte dans toutes ses fantaisies. Fort heureusement, Suzumiya arrivera à embrigader d'autres personnes afin de créer une organisation aux objectifs bien étranges : la "brigade SOS".

La SOS Brigade s'apprête à fêter Noël. Haruhi est très excitée à cette idée mais pas Kyon. Le 18 décembre, Kyon se rend au lycée comme d'habitude mais note quelques changements. Koizumi n'est plus là, Mikuru et Yuki ne le reconnaissent plus et Haruhi a disparu. Tout le monde semble avoir oublié l'énergique jeune fille.

Haruhi Suzumiya n’a aucun intérêt pour les humains ordinaires. En revanche les Aliens, les voyageurs temporels, les voyageurs dimensionnels et les Espers qui se promèneraient dans son nouveau lycée sont plus que bienvenus. Pour faciliter ses recherches dans l'univers du paranormal, Haruhi décide de créer son propre club associatif : SOS Brigade. Après avoir réquisitionné un local elle forcé quelques lycéens à en devenir membre. Objectif : découvrir tous les mystères du monde et les résoudre !

Suzumiya Haruhi-chan no Yuutsu fait (re)découvrir les personnages comme vous ne les avez jamais vu. Yuki Nagato est une otaku qui se sert de Ryôko Asakura comme d'un jouet et Mikuru Asahina à la capacité de se transformer en animal ! L'humour est omniprésent et l'histoire parodie l’ouvre originale.

Yuki Nagato est la présidente du club de littérature. Mais elle est très introvertie et a peu confiance en elle. Un jour, un élève de son école rejoindra son club, et ce sera le début d'un grand changement pour notre héroïne... Ce spin-off de La Mélancolie de Haruhi Suzumiya est bien évidemment centré sur le personnage de Yuki Nagato, et certains personnages de l'univers original seront présents dans cette toute nouvelle version de l'histoire...