L'histoire de déroule dans un univers parallèle où Tokyo a été en partie rayée de la carte. En effet, une grande partie de la ville a été recouverte par un immense dôme noir. Tous les êtres vivants prisonnier du dôme y sont morts mais 8 enfants parvinrent à quitter la ville indemnes. Séparés par la vie, ils ont ensuite peu à peu tout oublié. Dix ans plus tard, les 8 enfants, désormais adolescents, sont réunies au sein d'une même équipe, la Team Gargouille, afin de lutter contre les Imashime, les créatures peuplant le dôme et attaquant les humains vivant à l'extérieur de ce dernier une fois la nuit tombée.