Mononoke se focalise sur le personnage de l'apothicaire du troisième arc d’Ayakashi : un apothicaire itinérant avare de paroles, si bien que l'on ne sait même pas son nom. Il se déplace accompagné de son armoire à pharmacie et d'un coffret recelant une épée spirituelle dont le pommeau est orné d'une tête de singe. Grâce à d'étranges pouvoirs, il est capable de ressentir les énergies maléfiques qui émanent des ayakashi, des esprits qui voguent entre les mondes, et redoute particulièrement les mononoke, une forme d'ayakashi liée à notre monde afin d'exercer sa vengeance. Son épée spirituelle ne pouvant être dégainée que sous certaines conditions, l'histoire sera toujours centrée sur l'aspect psychologique du mononoke.

Ce manga adapte l'anime Mononoke, produit en 2007 par la Toei Animation pour le programme noitaminA. Chaque tome correspond à un arc de la série TV originale.Kusuriuri est un personnage atypique. Apothicaire, il erre de villages en villages et propose ses produits aux potentiels clients dans le besoin qu'il rencontre. En plus de son activité de vendeur ambulant, il est également exorciste et profite de ses larges connaissances du surnaturel pour venir en aide à de pauvres âmes en peine, hantées par des esprits et monstres malfaiteurs.