Train Hearthnet est un tueur à gage de l'organisation Chronos surnommé le BLACK CAT (n°XIII), et a un passé très lourd qui ne cesse de le hanter. Un jour, il rencontre Saya, une chasseuse de prime qui va lui donner sa vision de la vie et va réussir à le changer peu à peu...

Lors d'une mission, Train refuse de tuer Eve, une jeune fille issue des expériences sur les armes biologiques et abandonne Chronos.

Mais c'est alors que Saya, devenue alors sa meilleure et seule amie meurt, assassinée par l'ancien partenaire Creed Diskence de Train. Train n'a maintenant qu'un seul désir : la venger ! Mais autour de lui, des phénomènes étranges naissent...