Light Yagami est un lycéen âgé de 17 ans, jeune homme brillant, fils d’un policier, il découvre un étrange carnet qui se révèle être le livre d’un dieu de la mort : Ryûk ! Light apprendra vite quels terribles pouvoirs renferment ce carnet : tous ceux dont le nom est inscrit dans le Death Note sont appelés à mourir dans les 40 secondes qui suivent ! Les implications sont énormes et en possession d’un tel carnet Light est potentiellement capable d’imposer sa loi à un monde qu’il estime perverti. Mais peut-on choisir qui va vivre et qui va mourir ? Certaines personnes méritent-elles de mourir par la seule volonté d’un adolescent, à la fois juge et bourreau pour une sentence irrévocable ? En agissant de la sorte Light devient lui-même un criminel, il éveille ainsi l’attention de L, enquêteur mystérieux mandaté par Interpol. Un duel sans merci s’engage entre ces deux esprits exceptionnels !

L'histoire se déroule plusieurs années après la mort de Light Yagami, un être puissant ayant utilisé le pseudonyme de Kira pour assassiner des criminels en masse. Le monde a changé et les autorités sont dorénavant au courant de l'existence du Death Note. Il y a des caméras de sécurité partout et les messages ainsi que les appels téléphoniques peuvent être facilement tracés par la police. Pour contourner cette sécurité, le Kira originel aurait utilisé un plan différent pour pouvoir tuer des criminels. Cependant, Tanaka a trouvé un autre moyen d'utiliser ce cahier...