L'histoire se déroule plusieurs années après la mort de Light Yagami, un être puissant ayant utilisé le pseudonyme de Kira pour assassiner des criminels en masse.

Le monde a changé et les autorités sont dorénavant au courant de l'existence du Death Note. Il y a des caméras de sécurité partout et les messages ainsi que les appels téléphoniques peuvent être facilement tracés par la police.

Pour contourner cette sécurité, le Kira originel aurait utilisé un plan différent pour pouvoir tuer des criminels. Cependant, Tanaka a trouvé un autre moyen d'utiliser ce cahier...