Le gouverneur de Tokyo, fraîchement réélu, fait l'objet d'un attentat à la bombe dans le métro de la capitale. Conan parvient à empêcher une catastrophe mais ne réussit pas à déterminer le coupable. Il élabore toutefois une théorie selon laquelle le poseur de bombes serait originaire de la station de ski de Kitanosawa.
Conan et sa bande se retrouvent donc en vacances à Kitanosawa, aussi bien pour la détente que pour l'enquête. Mais plusieurs évènements vont précipiter la résolution de l'énigme, qui impliquera notamment de sordides affaires que l'on croyait oubliées...