Béatrice, c'est le nom que l'on donne aux personnes capables d'utiliser cette nouvelle source d'énergie. Notre héros, Yoshimura Mamoru, est accepté dans une école réservée à ces élèves spéciaux. C'est là-bas qu'il rencontre Ayako Takasu qui tombe instantanément amoureuse de lui. Ce qui est étrange, c'est que cette fille est crainte de tous à cause de ses pouvoirs mais aussi parce qu'elle peut se montrer froide et violente...
Ainsi, le Conseil des étudiants, composé d'un certain nombre d'élèves spéciaux décide d'enrôler notre héros, voyant en lui un énorme potentiel ainsi qu'un appât pour approcher Ayako sans problème. C'est ainsi qu'il va se retrouver mêler aux mystères et dangers de la Béatrice...