Aichi Sendo est un garçon timide qui n'a pas du tout confiance en lui, il semble tout de même heureux lorsqu'il regarde blaster blade, une carte provenant de Vanguard qui est un jeu devenu très populaire.Morikawa Katsumi un camarade de classe qui recherche des cartes rares pour devenir plus fort aperçevra celle d'Aichi et lui volera, il fera donc tout pour la récuperer mais son camarade l'aura perdue pendant un combat mais il se trouve que le vainqueur est Kai Toshiki, le garçon qui a donné cette carte à Aichi, le jeune garçon va donc affronter Kai. À partir de là, il deviendra un joueur de vanguard et va faire plein de nouvelles conaissances.

Un nouveau jeu de cartes est à la mode : Vanguard. Sendo Aichi est un élève timide qui subit les moqueries de ses camarades. Son seul réconfort est une carte à laquelle il tient beaucoup, "Blaster Blade", offerte il y a plusieurs années. L'histoire commence lorsqu'un camarade de classe et mauvais joueur de Vanguard, remarque la carte rare de Aichi et décide de la lui voler. Pour récupérer sa carte fétiche, Aichi devra apprendre à jouer et à surpasser Kai Toshiki, le meilleur joueur du quartier.

Peu de temps après la fin de la saison 1, Aichi rencontre un mystérieux garçon qui lui montre que sur la planète Cray, les leaders des clans Kagero, Royal Paladin et Dark Paladin ont été capturés. Lorsqu'il se réveille, son deck Royal Paladin a disparu, laissant place à un jeu Gold Paladin qui lui est totalement inconnu. Personne à part lui, pas même Kai qui jouait avant un jeu Kagero, ne se souvient avoir joué ces clans. Un circuit de tournois Cardfight Vanguard réparti dans toutes les capitales d'Asie est alors annoncé, et l'organisateur n'est autre que le mystérieux garçon rencontré par Aichi. Celui-ci est dès lors résolu à gagner une étape du circuit afin de pouvoir rencontrer en personne le garçon et obtenir une explication. Aichi, Misaki et Kamui se lancent alors à la conquête du circuit, prêts à affronter les meilleurs joueurs du monde.