Europe, XVIIIème siècle. Presque 250 ans avant l'épopée des Chevaliers de Bronze, la Guerre Sainte contre les Enfers et le seigneur de l'au-delà fait rage comme jamais auparavant. Tenma, jeune garçon bagarreur, vit dans un petit village paisible avec ses deux meilleurs amis, la belle Sasha et le frêle Alone. Alors que tout semble aller pour le mieux, la Grande Guerre Sainte finit par les toucher et le village est rasé par une bataille dévastatrice entre les deux camps, durant laquelle l'âme du terrible Hadès s'empare du corps d'Alone pour en faire sa nouvelle incarnation terrestre. Dès lors, Tenma, devenu le Chevalier de Bronze de Pégase, n'a d'autre but que de combattre encore et encore pour ramener son ami des limbes où il s'est égaré... quitte à y perdre la vie !! Tandis que les assauts des forces des ténèbres font chaque jour plus de victimes de part le monde, et que les cheva

1990, la Guerre Sainte est sur le point de toucher à sa fin, les cinq chevaliers de bronze vêtus de leurs Kamui sont face à Hadès qui n'a aucune difficulté face à cinq chevaliers de bronze. Malgré le désavantage des chevaliers de bronze, un chevalier tiens toujours tête face à Hadès ce qui l'intrigua car Seiya de Pégase lui rappelait un ancien chevalier de la précédente guerre dont la ressemblance est très frappante. Ce chevalier du passé était Tenma, le chevalier Pégase d'il y a 250 ans. Retour 250 ans plus tôt, Dohko et Shion viennent d'accéder au rang de l'élite des chevaliers d'Athéna c'est à dire celui des chevaliers d'or et s'apprêtent à une future guerre sainte dont ils ignorent que le passé va joindre le futur.

Seiya est un orphelin qui, tout jeune, a été sélectionné par la fondation Kido pour ramener des armures de bronze légendaire au Japon. Il réussira ainsi que 10 autres orphelins. Contraints par la fondation de s'exposer dans un "show", les chevaliers entameront un tournoi avant que l'enjeu, l'armure d'or, ne soit dérobé. Il comprendront peu à peu que leurs problèmes viennent du Sanctuaire, en Grèce, là où résident les 12 plus puissant chevaliers, les chevaliers d'or, ainsi que leur chef, le Grand Pope. La cible de celui-ci est la jeune Saori Kido, héritière de la fondation, et réincarnation d'Athéna.

Shura, le chevalier d’or du Capricorne, s’est désolidarisé du Sanctuaire pour devenir l’assassin des assassins. Il est guidé par la chouette Kokuto, qui lui délivre les oracles de la déesse Athéna et guide son bras vers la justice. Mais le grand Pope n’accepte pas qu’un de ses chevaliers échappe à son emprise. Il a envoyé à sa poursuite l’un de ses plus terribles guerriers : Aiolia du Lion. Alors que les deux chevaliers se préparent à s’affronter, ils se retrouvent au cœur d’un conflit bien plus important : La Guerre des Épées Sacrées.