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Quelque part en mer des Philippines, un immense complexe sous-marin appelé «Cofdeece» repose à 6000 mètres de profondeur. Fruit d'une collaboration tendue entre une entreprise japonaise et son partenaire chinois, cette infrastructure a été autrefois le théâtre d'un très grave accident qui a décimé tous ses occupants de l'époque. Trois ans après ce drame, Kengo Kadokura, un jeune ingénieur quelque peu apathique, est amené à descendre dans les abysses pour préparer la réouverture de la station, alors même que la cause de l'accident reste toujours inexpliquée. Mais très vite, Kengo sera confronté à des visions d'horreur, puis à l'inimaginable.