Tandis que la population de Tôkyô et des villes environnantes s’accroît, il faut sans cesse construire de nouveaux logements et pour cela, étendre les villes en terraformant la campagne alentours. Les tanukis voient leur habitat naturel se rétrécir comme peau de chagrin. Ils entament alors un combat de la dernière chance pour stopper l’avancée des hommes et préserver leur cadre de vie. Heureusement, ils ont plus d’un tour dans leur sac et peuvent notamment se métamorphoser à volonté.

Yakumo, monarque déchu du Royaume des Ombres arrive sur Terre pour ouvrir les cinq portes. Les éléments sacrés qu'elles enferment lui serviront à faire renaître son univers. Banni après avoir perdu la guerre contre le Royaume des Morts, le temps de la vengeance est enfin arrivé. Yusuke et ses amis, prévenus du danger par Botan, parviendront-ils à contrer les plans de Yakumo ?