Depuis leur rencontre aux toilettes, Hanako-kun et son assistante humaine, Nene Yashiro, font tout ce qui est en leur pouvoir pour maintenir le fragile équilibre entre le monde des humains et celui des esprits. Avec les multiples incidents surnaturels qui ont lieu au sein de l’Académie Kamome, le duo a généralement fort à faire au quotidien ! Mais que font-ils lorsqu’ils ont un petit moment de répit ? Participer à des jeux, changer de sexe, tomber malades, ou encore découvrir les nombreux secrets qui bouleversent le monde : les activités ne manquent pas lorsqu’il s’agit de passer un peu de bon temps après les cours…

L'Académie Kamome fait l'objet d'une étrange rumeur selon laquelle elle serait entourée de 7 grands mystères. Parmi eux, il y Hanako, un esprit se trouvant dans les toilettes des filles au 3e étage du bâtiment qui est capable d'accorder un vœu à quiconque faisant appel à lui. Tout commence lorsque Yashiro Nene, une élève fraîchement inscrite à l'école, l'invoque afin de profiter de ses services. Seulement, les choses ne se sont pas déroulées comme prévu et finit à la place par devenir sa servante !