Le sergent Keroro, est une grenouille verte extraterrestre coiffée d'une casquette à rabats, qui a reçu l'ordre de l'avant-garde d'envahir la Terre par son peuple. Pauvres de nous... ?! En fait pas vraiment car il devra d'abord réussir à convaincre la famille Hinata qui l'a recueilli, et étant ainsi prisonnier, car il a été pris en flagrant délit en train de s'infiltrer chez eux.

Bref, cette invasion, ce n'est pas gagné car Fuyuki, le jeune garçon de la famille lui a pris sa Keroball, lui permettant de contacter le vaisseau-mère, et a même perdu ses compagnons sur cette vaste Terre !

De leur côté, les frère et soeur Fuyuki et Natsumi Hinata auront toutes les peines du monde à l'adopter et à éviter les catastrophes que Keroro ne manque pas de provoquer !